История Metal Slug начинается много раньше выхода первой части этой популярнейшей серии. Та же команда, что была авторами данной игры, создала под руководством японской компании Irem серию хитов на железе автомата M92: Gunforce (1991), In the Hunt (1993) и Gunforce II (1994). Последнюю игру истиные фанаты Metal Slug нередко называют "Metal Slug Zero". Действительно, геймплей, звуки, анимация - многое в этих играх свидетельствует о родстве с Metal Slug. Заимствуя массу находок из творения Irem игра от Nazca тем не менее вводит ряд новшеств, которые и превратили очередной шедевр в хит. 2026 год. Мир лицом к лицу столкнулся с угрозой мирового терроризма. Маленьким, но чрезвычайно многочисленным и хорошо организованным группировкам террористов Восстания, противостоит мощная, отлично вооруженная Регулярная Армия. Один из важных офицескрих чинов РА, генерал морской пехоты Дональд Морден, имеющий репутацию отличного офицера и любящего отца, теряет сына в результате фатальной ошибки разведслужб и халатности высшего офицерского командования армии, погрязшего в коррупции и взяточнистве. Генрал Морден начинает собственную войну против РА и стает во главе Восстания. Под его руководством войска Восстания, пополненные перебежчиками и оружием, превращаются в грозную силу и начинают подготовку массированного наступления на отряды и базы РА по всему миру. Несмотря на имеющиеся разведданные о намерениях Восстания высшие чины РА не позаботились о принятии надлежащих контрмер. В итоге, пойманное врасплох наступлением террористов руководство РА срочно начинает готовить запоздалые планы контрнаступления на силы Восстания. В этих целях быстрыми темпами начата разработка сверхсекретной программы по созданию мощного наступательного оружия под кодовым именем SV-001.